سید محمّدتقی فاطمی در سال ۱۲۸۲ در اصفهان دیده به جهان گشود. او پس از گذراندن تحصیلات ابتدایی و متوسطه، در سال ۱۳۰۶ برای ادامۀ تحصیل به فرانسه رفت و در سال ۱۳۱۲ تحصیلات عالی خود را در رشتۀ ریاضی در دانشسرای عالی پاریس به پایان رساند و به ایران بازگشت و در دانشسرای عالی تهران به تدریس مشغول شد.
وی در سال ۱۳۴۷ پس از بازنشستگی از دانشگاه تهران، به مشهد آمد و مدیریت گروه ریاضی دانشگاه مشهد را بر عهده گرفت.
دکتر سید محمّدتقی فاطمی را «پدر علوم ریاضی نوین ایران» لقب داده‌اند.
او در ۱۷ آذرماه سال ۱۳۷۴ درگذشت.